Sous cette appellation sont regroupées l’ensemble des activités que des pasteurs, des diacres ou des laïcs de l’Eglise vaudoise développent dans le cadre d’une institution ou d’un établissement (hôpitaux, EMS, prisons, etc.).
Il y a douze aumôneries, pilotées par des conseils d’aumônerie dont les membres se rencontrent régulièrement durant l’année.